面对学长们的打趣,赵阳面带微笑。
“怎么会,我对生物可从来都没放弃的打算。”
赵阳看著眼前这些熟人笑著说到。
“別站著了,坐吧。我给你倒杯水。”
顾青走到饮水机旁,拿了一个一次性纸杯给赵阳接了一杯温水,递给他。
“谢谢。”赵阳接过水杯。
就在几人閒聊的时候,实验室里侧的办公室门推开了。
顾明教授拿著一沓列印出来的文献,正低头看著,一边走出来一边说道:“顾青,上周提的那个rna样本的浓度是不是不太对,测序公司那边反馈说建库失败了……”
话说到一半,顾明教授抬起头,一眼就看到了站在实验室中间的赵阳。
顾明教授的脚步一顿,拿著文献的手停在半空,脸上先是一愣,接著面上露出笑容。
“赵阳!你小子怎么来了?”
顾明教授快步走过来,欣喜的看著赵阳说道。
“这段时间在网上可是天天看你的新闻啊,又是解决孪生素数猜想,又是发nips,然后最近还被mit邀请当访问学者,你的新闻真是一刻不停啊!学术明星了现在!”
顾明教授开了个玩笑,语气里充满了对赵阳的欣赏。
绝大部分的教授,对於手底下的天才学生,都会欣赏。
赵阳也笑了笑:“顾教授您言重了。我再是学术明星,也是您实验室的实习生不是嘛!你看,我这不就回实验室来报到了吗。”
“回实验室报到?”
顾明教授愣了一下,他眼神之中带著不敢相信朝著赵阳確认道,“大家这段时间私底下都聊,说你以后肯定去搞纯数学或者去硅谷搞人工智慧了。怎么,你还打算继续搞生物?”
在顾明看来,赵阳在数学和计算机领域展现出的天赋,隨便在哪一条道上走下去,都是前途无量的。
相比之下,生物学现在的研究太苦、太枯燥,而且很难像数学那样靠个人天赋一锤定音,往往需要漫长的实验周期去熬结果。
更关键的是,很多时候,生物实验並不全靠个人天赋,有时候还要一定的运气,有时候要的还是一些顶尖的实验器械。
反正顾明是想不明白,赵阳为什么还要回来搞生物。
这不是浪费自己的天赋吗?
看著顾明和周围这些人不解的眼神成。
赵阳笑了笑说到。
“怎么会不搞生物。”
“生物学是探究生命本质的学科。我之前就跟您说过,我对这方面很感兴趣。”
他看著顾明教授,直接切入正题:“顾教授,我这次回来,是想继续在您的实验室里待著。如果有什么新的课题或者实验项目,我们一起搞。”
顾明教授听到这话,自然是欣喜万分,毫不犹豫地答应下来。
“求之不得啊!你这脑子要是能继续放在咱们课题组里,那绝对是大杀器。”
顾明教授大笑起来,隨后招了招手,“既然你打算回来,那正好,咱们去会议室。我正因为最近的一个项目头疼呢,咱们开个短暂的组会,顺便给你同步一下进度。”
顾青和另外两个学长也放下手里的活,跟著一起走进了旁边的小会议室。
大家围坐在会议桌旁,顾青坐在赵阳的斜对面,拿出了工作笔记。
顾明教授將手里的文献放在桌上,表情变得严谨起来,进入了工作状態。
“赵阳,既然你回来了,我也就不藏著掖著了。咱们实验室最近接了一个国家自然科学基金的面上项目。”
顾明教授打开会议室的投影仪,连接上自己的笔记本电脑。
幕布上出现了一张复杂的基因表达调控网络图。
“这个项目是关於某种特定农作物在重度乾旱胁迫下的耐旱机制研究。”
顾明教授指著图上的节点说道。
“我们前期的思路很明確。通过提取乾旱处理组和正常对照组的作物叶片rna,进行高通量的转录组测序(rna-seq)。试图找出那些在乾旱条件下显著上调錶达的耐旱关键基因。”
“目前的难点在哪里?”赵阳看著幕布上的图,直接问道。
既然是测序,那就有现成的数据。有了数据,对於他来说就好办。
顾明教授嘆了口气,有些无奈地说道:“难点在於数据量太大,而且噪音极其严重。”
“测序公司把数据发回来了,足足有几个tb的原始测序序列(reads)。我们虽然也懂一些基础的生物信息学分析,会用现成的商业软体去比对参考基因组,计算表达量。但是……”
顾明教授敲了敲桌子:“但是我们发现,这次测序得到的数据里,存在大量的假阳性差异表达基因。因为这种作物本身的基因组非常庞大且复杂,含有大量的重复序列。
常规的软体比对下来,找出了几万个差异基因,根本没办法进行下游的验证实验。我们不知道到底哪个才是真正起核心调控作用的主开关基因。”
旁边戴眼镜的学长也苦著脸补充道:“是啊赵神。我们这一个多礼拜,天天盯著那些火山图和热图看,眼睛都快瞎了。找出来的几个候选基因,做实时萤光定量pcr验证的时候,全都不符合预期。现在整个项目卡在数据分析这一步,没法往下推了。”
赵阳听完,大概思索了一下。
很快,他就大概明白了顾明教授他们的困境。
生物学家擅长设计实验、提取样本和操作验证,但面对海量的高维度测序数据时,如果仅仅依赖市面上那些打包好的商业软体或者开源的流程脚本,很容易陷入数据的泥潭。
因为那些现成的软体都是基於通用的统计模型,无法针对特定的复杂基因组进行算法上的底层优化。
“所以,你们现在需要一种更精確的算法,从这几万个假阳性的噪音中,把真正具有生物学意义的核心节点给挖出来,对吗?”
赵阳看著顾明教授问道。
“没错。”
顾明教授点了点头。
“但咱们实验室没有专业的生信分析大牛。原本指望这几个研究生慢慢筛,但进度实在太慢了。”
第212章 臥槽, 赵神来了!
同类推荐:
娇门吟(H)、
武道从练刀开始、
这些书总想操我_御书屋、
逆战苍穹、
不朽灵魂、
仙绝恋、
逆凡之巅、
双穴少女和她的触手男友、

